莎車遠(yuǎn)在西周成王誦時期就已開始與中原保持聯(lián)系，曾進獻白玉、野馬等物。

　　漢武帝曾兩次派張騫出使西域，都途經(jīng)莎車等地。漢元康元年（前65）,宣帝劉詢應(yīng)莎車國使節(jié)之求，遣使者奚充國送解憂公主（嫁烏孫王）之子萬年出任莎車王，莎車歸屬漢朝。漢神爵二年（前60）,漢朝在烏壘設(shè)西域都護府，莎車受其管轄。東漢建武五年（29）,漢遣河西大將軍竇融承制封莎車王康為建功懷德王、西域大都尉。東漢永平車年（61）,莎車被于闐兼并。其后，匈奴又將莎車王賢的質(zhì)子不居徵立為莎車王。永平十六年（73）假司馬班超與從事郭恂使西域，其時于闐王廣德，又攻殺不居徵，立其弟齊黎為莎車王，莎車時順時叛漢朝。班超發(fā)于闐等國兵擊敗莎車。漢永元三年（96）,漢復(fù)立西域都護，莎車受其管轄為。永初元年（107）六月，漢罷西域都護府，莎車又役屬匈奴。

　　魏黃初二年（221）,設(shè)西域戊已校尉，莎車歸魏。晉泰始元年（265）,晉代魏立，仍置西域戊已校尉，莎車歸晉。晉咸 康二年（336）,西域盡入前涼版圖，今縣境受其管轄。晉太元九年（384）,前秦將軍呂光征龜茲獲勝，今莎車一帶使節(jié)隨鄯善王比龍入朝，向?qū)幏Q臣貢獻。北魏太延元年（435）西域諸國相繼朝貢于魏，《魏書》稱渠沙國為故莎車城。北魏和平元年（460）,柔然汗國占據(jù)天山一帶，今縣境屬柔然勢力工范圍。高昌沮渠余眾的一部分奔莎車，沮渠被譯作“朱居波”、“悉居半”、“遮拘迦”等，今莎車一帶在朱居波屬高車的勢力范圍，北魏太和二十一年（497），吠噠占據(jù)天山南路，朱居波受吠噠統(tǒng)治。北周保定二年（562）,突厥與波斯聯(lián)合擊敗吠噠，突厥勢力進入今縣境。

　　隋仁壽三年（603）,突厥汗國正式分裂為東西兩個汗國，今縣境受西突厥統(tǒng)轄。

　　唐貞觀二十一年二十二年（647～648）,唐伐龜茲，葉蕃發(fā)兵助戰(zhàn)，其勢力一度進入昆侖山北麓今莎車一帶。唐顯慶四年（659）,唐朱居波等地置州、府、縣。唐咸亨元年（670）,吐蕃陷安西四鎮(zhèn)，今縣境為吐蕃占有。唐咸亨四年（673）,長史蕭嗣業(yè)統(tǒng)東突厥部西征，重新控制蔥嶺以東，今莎車一帶又歸唐朝管理。唐天寶十四載（755）,“安史之亂”后，唐在西域的駐軍被調(diào)往內(nèi)地，吐蕃乘機奪取河瀧之地。至8世紀(jì)90年代初，南疆地區(qū)全部落入吐蕃之手，縣境一帶為吐蕃轄地。9世紀(jì)末，今莎車境屬喀拉汗朝。

　　宋太祖開寶三年（971）,今縣境一帶在西方文獻中被稱為鴨兒看，后譯為葉爾羌。宋建炎二年（1128），今莎車一帶屬西遼，宋嘉定十一年（1218）屬蒙古汗國。蒙古太祖二十年（1225）,成吉思汗將其領(lǐng)地分封諸子，鴨兒看，在察合臺汗封地之內(nèi)。元至元十一年（1274）,元世祖忽必烈下詔安撫鴨兒看。元大德六年（1320）葉爾羌東察合臺汗國。

　　明正德九年（1514）,莎車古城為薩亦德建立的葉爾羌汗國國都，莎車城成為葉爾羌汗國的政治、經(jīng)濟、文化中心。清康熙十七年（1678）,葉爾羌?xì)w屬準(zhǔn)噶爾汗國。乾隆二十四年（1759）,清政府平定大小和卓之亂后，定邊將軍和參贊大臣駐扎葉爾羌城處理新疆軍政大事。其后設(shè)辦事大臣、參贊大臣。清光緒二十八年（1902）,莎車直隸州升為府，所置皮山縣、蒲犁廳（今塔什庫爾干縣）屬莎車府管轄。

　　民國初年仍沿襲清末舊制，民國2年（1913）撤府設(shè)縣，設(shè)立莎車縣，仍由喀什噶爾道轄。民國17年（1928）,莎車劃為莎車、葉爾羌兩縣。民國31年（1942），新疆省府決定將兩縣合并，在莎車設(shè)第十區(qū)行政長官公署，后改為莎車行政督察專員公署，轄莎車、澤普、葉城、麥蓋提4縣。直至1949年9月25日新疆和平解放，莎車一直為專署所在地。

　　1956年4月21日，莎車專署撤銷，莎車縣隸屬喀什專區(qū)。