青云譜區(qū)歷史悠久。宋朝學者樂史在其編著的《太平環(huán)宇記》中早有"青云浦在（南昌）城南十五里"的記載。明末清初八大山人朱耷（畫家）在此隱居，改青云浦為青云圃，清嘉慶20年（1815），禮部尚書戴均元又將"圃"改為"譜"，即今名。史載其"為南昌灌城鄉(xiāng)"，紀漢開國名將灌嬰筑城事，可知它原是南昌的發(fā)祥地。溯其淵源，此地先后隸屬豫章郡（漢）、 宜善縣（新莽）、洪州（唐至北宋）、隆興府（南宋、元初）、龍興路（元）、南昌府（明、清）。民國時期，先后直隸豫章道，省轄；后隸屬江西省第一行政區(qū)（其中1939-1941年隸屬第11行政區(qū)）。解放后，1949年9月以前，曾劃為南昌市第六區(qū)的一部分，同年10月，一度劃到南昌縣；1950年下半年，又劃為南昌市第六區(qū)，到1958年10月，由三家店鎮(zhèn)、青云譜鄉(xiāng)、城南鄉(xiāng)三者合并成立青云譜區(qū)。

　　約在5000年前，此地撫河東岸的崗地丘陵（窯頭村）一帶，早有新石器時期的原始人居住，最初的居民為百越族、紋身。出土的石刀、石斧、石箭頭等可知先民靠漁豬、農耕為生。據《尚書·禹貢》記載：在夏、商、周三代，區(qū)境已被列入"揚州地域"，春秋戰(zhàn)國時，此地處吳之東、楚之西，故稱"吳頭楚尾"之地。周元王三年（前473）越滅吳，屬越地；楚威王七年（前333），楚滅越，屬楚地。秦始皇統(tǒng)一中國，區(qū)境屬九江郡，但其時尚無城市之設。漢高祖六年（前201），南昌建城后，區(qū)境叫灌城鄉(xiāng)。晉朝建興元年（313）道士許遜偕弟子黃仁覽入境，于梅仙祠舊址創(chuàng)建道院名"太極觀"。隋開皇九年（589），隋文帝楊堅賜號南昌全真道士萬振為"天師"，改"太極觀"為"太乙觀"。到明末清初畫家八大山人在此隱居，現(xiàn)辟為八大山人紀念館。歷代文人墨客多慕名來此。稱贊："南昌名勝之區(qū)，首推青云譜。昔人莫不喜憩斯地，以覽風光，而拓胸臆"。有內十景外十景（或內外各十二景）之謂。